La Universidad del Claustro de Sor Juana lleva a cabo sus compromisos fundamentales bajo el signo principal del humanismo, el amor a la patria y a la cultura, y la excelencia académica. La Universidad del Claustro de Sor Juana cumple su quehacer con la conciencia del compromiso con la búsqueda de la verdad y el conocimiento, la defensa de la libertad y la palabra, sobre todo de la dignidad de la persona; nos sabemos corresponsables del destino de nuestro país, es por eso que afirmamos que somos una universidad privada con vocación pública.

La Universidad del Claustro de Sor Juana pertenece al Padrón de Excelencia de la Secretaría de Educación Pública, lo que implica haber cumplido todos los requisitos establecidos por la SEP y haber sido acreditados sin recomendaciones por la Federación de Instituciones Mexicanas Particulares de Educación Superior por haber cumplido la totalidad de los 166 indicadores de calidad establecidos en su normatividad. La Universidad del Claustro de Sor Juana busca que se cumpla el sentido moral que debe tener la inteligencia, fortaleciendo el espacio donde ésta se comprometa, donde la libertad y la interrogación se desplieguen, donde se dé el diálogo sin dobles intenciones, sin afán de dominio, donde se elimine la arbitrariedad y se trabaje a favor de la dignidad del ser humano y del derecho a la diferencia.

La Universidad del Claustro de Sor Juana pretende abrir un espacio desde el cual podamos intervenir social y discursivamente en el entramado cultural al cual pertenece. La Universidad del Claustro de Sor Juana construye día con día un proyecto educativo auténtico, sin ataduras ideológicas ni económicas. Esto significa que no depende de ninguna manera y bajo ninguna circunstancia de ningún gobierno, de ningún partido político, de ninguna iglesia, de ninguna empresa. La Universidad del Claustro de Sor Juana es una institución independiente y promueve su autonomía.